FKIP Uhamka mulai berdiri sejak 1997, dengan konversi IKIP Muhammadiyah Jakarta menjadi Universitas Muhammadiyah Prof Dr Hamka. Dekan Fakultas Pendidikan Ilmu Pengetahuan Sosial, Drs. Ramli Sairin, MM, menjadi Dekan pertama FKIP Uhamka periode 1997 - 2004. Pak Ramli juga aktif sebagai Bendahara Kwartir Nasional Gerakan Pramuka masa bakti 2003 - 2013.
Dekan kedua adalah Prof. Dr. Wr. Hendra Saputra, M.Hum. dengan masa jabatan 2004-2008. Berasal dari Program Studi Pendidikan Sejarah, menyelesaikan program doktoral dari jurusan Ilmu Pemerintahan Institut Ilmu Pemerintahan di Jakarta. Dosen Kopertis (sekarang LLDikti) dpk di Uhamka, alumni Pendidikan Sejarah IKIP Muhammadiyah Jakarta dan S2 Ilmu Sejarah di Universitas Indonesia.
Dekan ketiga adalah Dr. Sukardi, M.Pd. Dekan FKIP selama dua periode (2008-2012, dan 2012- 2016.Menyelesaikan doktoral di Universitas Pendidikan Indonesia, Bandung. Dosen Tetap Persyarikatan yang sekarang mendapat amanah sebagai Rektor Universitas Muhammadiyah Bogor Raya, di Jawa Barat. Alumni IKIP Muhammadiyah Jakarta (Uhamka) dari Program Studi Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia. Saat ini - "Pak Edy" nama panggilannya - juga masih menjabat sebagai Ketua Pimpinan Daerah Muhammadiyah Jakarta Selatan. Aktif di Muhammadiyah tingkat pusat di Lembaga Sosial Budaya, budayawan yang sudah menciptakan ribuan puisi sampai sekarang.
Dekan keempat adalah Dr. Desvian Bandarsyah, M.Pd. menjabat sebagai Dekan pada masa jabatan 2016 - 2020, dan 2020 - 2023. Lulusan S3 jurusan Pendidikan Ilmu Pengetahuan Sosial Universitas Pendidikan Indonesia, Bandung, ini diangkat sebagai Wakil Rektor II Uhamka masa jabatan 2023 - 2027. Dosen Tetap persyarikatan yang berasal dari Program S1 Pendidikan Sejarah IKIP Muhammadiyah Jakarta, juga alumni program S2 Pendidikan Sejarah Universitas Negeri Jakarta. Selain menjadi Pengurus Forum Komunikasi Alumni Ikatan Mahasiswa Muhammadiyah tingkat Nasional dan DKI Jakarta, juga menjabat sebagai Wakil Sekretaris Majelis Pendidikan Dasar, Menengah dan Pendidikan Non Formal Pimpinan Pusat Muhammadiyah. Sebelumnya juga aktif di Pimpinan Daerah Muhammadiyah Jakarta Timur, serta Majelis Dikdasmen PDM Jakarta Timur.
Dekan kelima, yang masih menjabat saat ini adalah Purnama Syae Purrohman, M.Pd., Ph.D. menempuh doktoral di Central China Normal University, Wuhan, China. Dosen Tetap Persyarikatan yang juga alumni Pendidikan Ekonomi IKIP Muhammadiyah Jakarta/Uhamka. Studi S2 di Program Pendidikan Ilmu Pengetahuan Sosial Universitas Negeri Yogyakarta, dan S3 di Jurusan Education Economy and Management, Central China Normal University, Wuhan, Hubei, Republik Rakyat China.
Sebelumnya aktif di Asosiasi Kantor Urusan Internasional Perguruan Tinggi Muhammadiyah 'Aisyiyah se Indonesia sejak tahun 2018, dengan jabatan terakhir sebagai Wakil Ketua. Serta pernah juga aktif sebagai Ketua Bidang di Majelis Pendidikan Dasar dan Menengah Pimpinan Daerah Muhammadiyah Jakarta Timur. Saat ini sebagai pengurus aktif di Majelis Ekonomi, Bisnis dan Pariwisata Pimpinan Wilayah Muhammadiyah DKI Jakarta.